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GoPubMed生醫搜索引擎

我們之前提過的「PubMed期刊論文搜尋引擎」,經年累月以來,已有超過1千5百萬的生醫類文獻;然而,資訊量過大隨之而來的問題便是無法有效率地找到想要找的文獻。為了解決這方面的問題,德國德瑞斯頓工業大學(Technical University of Dresden)與Transinsight公司於2005年共同開發了GoPubMed網路伺服系統。

GoPubMed利用Gene Ontology(GO,基因本體)理論來對PubMed資料庫進行標籤及搜尋。GO是一項生物資訊專案(請參考Gene Ontology website),目的是統整生物領域間對基因和基因產物的用語,改善學術溝通、資訊分享等問題。GO包含三個部份:

  • Cellular component—細胞的組成「零件」和細胞外環境
  • Molecular function­—基因產物的分子功能,例如結合或催化
  • Biological process—生物體內與特定生物功能相關的分子過程

GoPubMed使用GO原則分類各文獻的摘要,GO分類標籤並顯示於所有搜出的文獻上,讓使用者能依照分類快速掃過各摘要,大大減少找到想要的資訊的時間。

簡單舉個例子:下圖為GoPubMed的搜尋結果,可以看到列出來的摘要裡的專有名詞都有附加的資訊,只要將滑鼠移到各單字上,便會跳出紅色箭頭指著的新對話框,裡面有該單字的相關資訊或連結。這項省時省力的附加功能,讓使用者能迅速了解該摘要內容和研究方向。

 

GoPubMed網頁上還有不少好用的搜尋或分類功能,建議常用PubMed的讀者,可換看看使用GoPubMed。記得與我們分享您的使用心得唷!

 

參考資料:

  1. GoPubMed生醫搜索引擎
  2. Gene Ontology website
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