{"id":306,"date":"2019-07-07T07:41:20","date_gmt":"2019-07-07T07:41:20","guid":{"rendered":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/latam\/?p=306"},"modified":"2019-07-16T08:09:44","modified_gmt":"2019-07-16T08:09:44","slug":"biological-databases-an-overview-and-future-perspectives","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/latam\/biological-databases-an-overview-and-future-perspectives\/","title":{"rendered":"Bases de datos biol\u00f3gicos: Una visi\u00f3n general y una perspectiva de futuro"},"content":{"rendered":"<span class=\"span-reading-time rt-reading-time\" style=\"display: block;\"><span class=\"rt-label rt-prefix\">Reading Time: <\/span> <span class=\"rt-time\"> 3<\/span> <span class=\"rt-label rt-postfix\">minutes<\/span><\/span><p>Las bases de datos biol\u00f3gicas surgieron como una respuesta a los enormes vol\u00famenes de datos generados por las tecnolog\u00edas de secuenciaci\u00f3n de ADN de bajo costo.\u00a0Una de las primeras bases de datos que surgi\u00f3 fue GenBank, que es una colecci\u00f3n de todas las secuencias de ADN y prote\u00ednas disponibles. Es mantenido por los Institutos Nacionales de Salud (NIH) y el Centro Nacional de Informaci\u00f3n de Biotecnolog\u00eda (NCBI). GenBank allan\u00f3 el camino para el Proyecto Genoma Humano (HGP). El HGP permiti\u00f3 la secuenciaci\u00f3n completa y la lectura del plano gen\u00e9tico. Los datos almacenados en bases de datos biol\u00f3gicas se organizan para un an\u00e1lisis \u00f3ptimo y se componen de dos tipos: sin procesar y curados (o anotados). Las bases de datos biol\u00f3gicas son complejas, heterog\u00e9neas, din\u00e1micas y, sin embargo, inconsistentes. \u00a0La inconsistencia se debe a la falta de est\u00e1ndares a nivel ontol\u00f3gico.<\/p>\n<div id=\"ez-toc-container\" class=\"ez-toc-v2_0_74 counter-hierarchy ez-toc-counter ez-toc-grey ez-toc-container-direction\">\n<div class=\"ez-toc-title-container\">\n<p class=\"ez-toc-title\" style=\"cursor:inherit\">Table of Contents<\/p>\n<span class=\"ez-toc-title-toggle\"><a href=\"#\" class=\"ez-toc-pull-right ez-toc-btn ez-toc-btn-xs ez-toc-btn-default ez-toc-toggle\" aria-label=\"Toggle Table of Content\"><span class=\"ez-toc-js-icon-con\"><span class=\"\"><span class=\"eztoc-hide\" style=\"display:none;\">Toggle<\/span><span class=\"ez-toc-icon-toggle-span\"><svg style=\"fill: #999;color:#999\" xmlns=\"http:\/\/www.w3.org\/2000\/svg\" class=\"list-377408\" width=\"20px\" height=\"20px\" viewBox=\"0 0 24 24\" fill=\"none\"><path d=\"M6 6H4v2h2V6zm14 0H8v2h12V6zM4 11h2v2H4v-2zm16 0H8v2h12v-2zM4 16h2v2H4v-2zm16 0H8v2h12v-2z\" fill=\"currentColor\"><\/path><\/svg><svg style=\"fill: #999;color:#999\" class=\"arrow-unsorted-368013\" xmlns=\"http:\/\/www.w3.org\/2000\/svg\" width=\"10px\" height=\"10px\" viewBox=\"0 0 24 24\" version=\"1.2\" baseProfile=\"tiny\"><path d=\"M18.2 9.3l-6.2-6.3-6.2 6.3c-.2.2-.3.4-.3.7s.1.5.3.7c.2.2.4.3.7.3h11c.3 0 .5-.1.7-.3.2-.2.3-.5.3-.7s-.1-.5-.3-.7zM5.8 14.7l6.2 6.3 6.2-6.3c.2-.2.3-.5.3-.7s-.1-.5-.3-.7c-.2-.2-.4-.3-.7-.3h-11c-.3 0-.5.1-.7.3-.2.2-.3.5-.3.7s.1.5.3.7z\"\/><\/svg><\/span><\/span><\/span><\/a><\/span><\/div>\n<nav><ul class='ez-toc-list ez-toc-list-level-1 ' ><li class='ez-toc-page-1 ez-toc-heading-level-2'><a class=\"ez-toc-link ez-toc-heading-1\" href=\"https:\/\/www.enago.com\/academy\/latam\/biological-databases-an-overview-and-future-perspectives\/#%C2%BFPor_que_son_importantes\" >\u00bfPor qu\u00e9 son importantes?<\/a><\/li><li class='ez-toc-page-1 ez-toc-heading-level-2'><a class=\"ez-toc-link ez-toc-heading-2\" href=\"https:\/\/www.enago.com\/academy\/latam\/biological-databases-an-overview-and-future-perspectives\/#Tipos_de_bases_de_datos_biologicas\" >Tipos de bases de datos biol\u00f3gicas<\/a><\/li><li class='ez-toc-page-1 ez-toc-heading-level-2'><a class=\"ez-toc-link ez-toc-heading-3\" href=\"https:\/\/www.enago.com\/academy\/latam\/biological-databases-an-overview-and-future-perspectives\/#El_futuro\" >El futuro<\/a><\/li><\/ul><\/nav><\/div>\n<h2><span class=\"ez-toc-section\" id=\"%C2%BFPor_que_son_importantes\"><\/span>\u00bfPor qu\u00e9 son importantes?<span class=\"ez-toc-section-end\"><\/span><\/h2>\n<p>Anteriormente, las bases de datos y los bancos de datos se consideraban bastante diferentes. Sin embargo, con el tiempo, \u201cbase de datos\u201d se convirti\u00f3 en un t\u00e9rmino preferible. \u00a0Los datos se env\u00edan directamente a las bases de datos biol\u00f3gicas para la indexaci\u00f3n, organizaci\u00f3n y optimizaci\u00f3n de datos. \u00a0Ayudan a los investigadores a encontrar datos biol\u00f3gicos relevantes al ponerlos a disposici\u00f3n en un formato legible en una computadora. Toda la informaci\u00f3n biol\u00f3gica es f\u00e1cilmente accesible a trav\u00e9s de herramientas de miner\u00eda de datos que ahorran tiempo y recursos. Las bases de datos biol\u00f3gicas pueden clasificarse ampliamente como bases de datos de secuencia y estructura. Las bases de datos de estructuras son para estructuras de prote\u00ednas, mientras que las bases de datos de secuencias son para secuencias de \u00e1cidos nucleicos y prote\u00ednas.<\/p>\n<h2><span class=\"ez-toc-section\" id=\"Tipos_de_bases_de_datos_biologicas\"><\/span>Tipos de bases de datos biol\u00f3gicas<span class=\"ez-toc-section-end\"><\/span><\/h2>\n<p>Las bases de datos biol\u00f3gicas pueden clasificarse adem\u00e1s como bases de datos primarias, secundarias y compuestas.<\/p>\n<p>Las bases de datos primarias contienen informaci\u00f3n solo para secuencia o estructura. Ejemplos de bases de datos biol\u00f3gicas primarias incluyen:<\/p>\n<ul>\n<li>Swiss-Prot y PIR para secuencias de prote\u00ednas<\/li>\n<li>GenBank y DDBJ para secuencias gen\u00f3micas<\/li>\n<li>Banco de datos de prote\u00ednas para estructuras de prote\u00ednas<\/li>\n<\/ul>\n<p>Las bases de datos secundarias contienen informaci\u00f3n derivada de bases de datos primarias. Las bases de datos secundarias almacenan informaci\u00f3n, como secuencias conservadas, residuos de sitios activos y secuencias de firmas. Los datos del banco de datos de prote\u00ednas se almacenan en bases de datos secundarias. Ejemplos incluyen:<\/p>\n<ul>\n<li>SCOP en la Universidad de Cambridge<\/li>\n<li>CATH en el University College de Londres<\/li>\n<li>PROSITE del Instituto Suizo de Bioinform\u00e1tica<\/li>\n<li>eMOTIF en Stanford<\/li>\n<\/ul>\n<p>Las bases de datos compuestas contienen una variedad de bases de datos primarias, lo que elimina la necesidad de buscar cada una por separado. Cada base de datos compuesta tiene diferentes algoritmos de b\u00fasqueda y estructuras de datos. El NCBI alberga estas bases de datos, donde se encuentran enlaces a la Herencia Mendeliana en el Hombre en L\u00ednea (OMIM).<\/p>\n<h2><span class=\"ez-toc-section\" id=\"El_futuro\"><\/span>El futuro<span class=\"ez-toc-section-end\"><\/span><\/h2>\n<p>Debido a las plataformas computacionales de alto rendimiento, estas bases de datos se han vuelto importantes para proporcionar la infraestructura necesaria para la investigaci\u00f3n biol\u00f3gica, desde la preparaci\u00f3n de datos hasta la extracci\u00f3n de datos. La simulaci\u00f3n de sistemas biol\u00f3gicos tambi\u00e9n requiere plataformas computacionales, lo que subraya a\u00fan m\u00e1s la necesidad de bases de datos biol\u00f3gicas. El futuro de las bases de datos biol\u00f3gicas se ve brillante, en parte debido al mundo digital.<\/p>\n<p>En t\u00e9rminos de investigaci\u00f3n, las herramientas de bioinform\u00e1tica deben racionalizarse para analizar la creciente cantidad de datos generados a partir de gen\u00f3mica, metabol\u00f3mica, prote\u00f3mica y metagen\u00f3mica. Otra tendencia futura ser\u00e1 la anotaci\u00f3n de los datos existentes y una mejor integraci\u00f3n de las bases de datos.<\/p>\n<p>Con una gran cantidad de bases de datos biol\u00f3gicas disponibles, la necesidad de integraci\u00f3n, avances y mejoras en bioinform\u00e1tica es primordial. La bioinform\u00e1tica avanzar\u00e1 de manera constante cuando se aborden los problemas relacionados con la nomenclatura y la estandarizaci\u00f3n. El crecimiento de las bases de datos biol\u00f3gicas allanar\u00e1 el camino para estudios adicionales sobre prote\u00ednas y \u00e1cidos nucleicos, que afectan a los campos terap\u00e9uticos, biom\u00e9dicos y relacionados. Si utiliza bases de datos biol\u00f3gicas y desea compartir alguna informaci\u00f3n, \u00a1comente en la secci\u00f3n a continuaci\u00f3n!<\/p>\n<!-- AddThis Advanced Settings generic via filter on the_content --><!-- AddThis Share Buttons generic via filter on the_content -->","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p><span class=\"span-reading-time rt-reading-time\" style=\"display: block;\"><span class=\"rt-label rt-prefix\">Reading Time: <\/span> <span class=\"rt-time\"> 3<\/span> <span class=\"rt-label rt-postfix\">minutes<\/span><\/span>Las bases de datos biol\u00f3gicas surgieron como una respuesta a los enormes vol\u00famenes de datos [&hellip;]<!-- AddThis Advanced Settings generic via filter on get_the_excerpt --><!-- AddThis Share Buttons generic via filter on get_the_excerpt --><\/p>\n","protected":false},"author":8212,"featured_media":307,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"om_disable_all_campaigns":false,"footnotes":""},"categories":[6,4],"tags":[139],"ppma_author":[195],"class_list":["post-306","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-phds-postdocs","category-career-corner","tag-research-data-management"],"acf":[],"single_webinar_page_date":null,"single_webinar_page_time":null,"session_agenda":null,"who_should_attend_this_session":null,"about_the_speaker_field":null,"co-webinar-sec":null,"co_webinar_sec_one":null,"speaker-name":null,"webinar-date":null,"webinar-time":null,"webinar-s-image":null,"custum_webinar_category":null,"authors":[{"term_id":195,"user_id":8212,"is_guest":0,"slug":"latameditor","display_name":"latameditor","avatar_url":"https:\/\/secure.gravatar.com\/avatar\/a9da5b9b2a636c5a99ad42885d4a2303d2670b561687dc14cf44436d79630c4f?s=96&d=mm&r=g","author_category":"","first_name":"","last_name":"","user_url":"","job_title":"","description":""}],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/latam\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/306","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/latam\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/latam\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/latam\/wp-json\/wp\/v2\/users\/8212"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/latam\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=306"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/latam\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/306\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":308,"href":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/latam\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/306\/revisions\/308"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/latam\/wp-json\/wp\/v2\/media\/307"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/latam\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=306"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/latam\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=306"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/latam\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=306"},{"taxonomy":"author","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/latam\/wp-json\/wp\/v2\/ppma_author?post=306"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}